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變性梯度凝膠電泳

簡(jiǎn) 變性梯度凝膠電泳(denatured gradient gel electrophoresis,簡(jiǎn)稱DGGE),是根據(jù)DNA在不同濃度的變性劑中解鏈行為的不同而導(dǎo)致電泳遷移率發(fā)生變化,從而將大小相同而堿基組成不同的DNA片段有效分開(kāi)。目前DGGE技術(shù)已廣泛應(yīng)用于環(huán)境樣本中細(xì)菌、古細(xì)菌、真菌等多種微生物多樣性的研究。

 

基本流程

技術(shù)優(yōu)勢(shì):

(1)       本公司擁有多種微生物PCR-DGGE引物:如細(xì)菌、真菌、古細(xì)菌、氨氧化細(xì)菌,而且這些引物在近幾年實(shí)現(xiàn)了對(duì)多種環(huán)境微生物樣本的群落結(jié)構(gòu)分析;

(2)       本公司對(duì)DGGE電泳膠圖具有較好的優(yōu)化方案,不僅電泳膠圖清晰,而且尿素濃度梯度優(yōu)化合理,有效實(shí)現(xiàn)了對(duì)不同堿基組成的靈敏性的分離。

客戶須知:

變性梯度凝膠電泳

周期

最終提供客戶資料

DGGE

10-14個(gè)工作日

詳細(xì)實(shí)驗(yàn)總結(jié)報(bào)告

 

案例

目前盡管微生物高通量測(cè)序在群落結(jié)構(gòu)分析中越來(lái)越發(fā)揮重要作用,但經(jīng)典的PCR-DGGE在對(duì)少量樣本分析中依然發(fā)揮著重要的作用。

以下實(shí)驗(yàn)例是細(xì)菌種群結(jié)構(gòu)差異對(duì)某植物果實(shí)形成的影響,該結(jié)果發(fā)表在“Applied and Environmental Microbiology (AEM) ”雜志上。部分結(jié)果如下:

 

客戶提供:

樣品類型

土壤和糞便樣本

水環(huán)境樣本

樣品需要量

500 mg

 

5ml

取樣和保存環(huán)境

無(wú)菌管收集,保存在-20℃或-80

無(wú)菌管收集、離心,保留沉淀,保存在-20℃或-80

運(yùn)輸

杭州市內(nèi)干冰上門(mén)取樣;

外地客戶干冰快遞運(yùn)輸;

組織保存液,冰袋運(yùn)輸

杭州市內(nèi)干冰上門(mén)取樣;

外地客戶干冰快遞運(yùn)輸;

 

*(經(jīng)本公司評(píng)估后,實(shí)驗(yàn)沒(méi)有結(jié)果,不收取任何費(fèi)用)

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